Biopsie lichida NeoThetis Melanom – ADN tumoral circulant, 28 gene

Biopsie lichida NeoThetis Melanom – ADN tumoral circulant, 28 gene

Ce este biopsia lichidă NeoThetis Melanom

Biopsia lichidă NeoThetis este un test de profilare moleculară a tumorilor, bazat pe analiza ADN-ului tumoral circulant (ctDNA) din plasmă. Testul identifică modificările genetice asociate tumorilor solide printr-o metodă minim invazivă: se face dintr-o probă de sânge periferic și nu necesită biopsie tisulară.

Biopsia tisulară convențională analizează o singură regiune a tumorii. Analiza ctDNA poate arăta modificări genetice provenite atât din tumora primară, cât și din metastaze, deci oferă o imagine mai amplă asupra heterogenității tumorale.

Celulele tumorale eliberează în sânge fragmente de ADN liber circulant (cfDNA). Acestea sunt analizate prin secvențiere de nouă generație (NGS), o tehnologie cu sensibilitate ridicată, care detectează variante genetice prezente în concentrații foarte mici în plasmă. Se pot identifica mai multe tipuri de alterări genetice cu relevanță clinică:

• mutații punctiforme (SNV);
• inserții și deleții (INDEL);
• amplificări genetice (CNA);
• rearanjamente și fuziuni genice.

Alterările identificate sunt clasificate și raportate conform recomandărilor internaționale actuale.

NeoThetis Melanom este un panel dedicat profilării moleculare a melanomului. Analizează 28 de gene implicate în dezvoltarea, progresia și răspunsul la tratament al acestui tip de cancer. Panelul include gene cu relevanță clinică recunoscută în oncologia melanomului, implicate în:

• căile de semnalizare MAPK și PI3K/AKT;
• proliferarea tumorală;
• răspunsul la terapiile țintite.

Exemple de astfel de gene sunt BRAF, NRAS, KIT, NF1, MAP2K1 și PTEN.

Panelul evaluează și instabilitatea microsateliților (MSI), un biomarker cu potențial predictiv pentru răspunsul la imunoterapie. Statusul MSI-H (instabilitate crescută) poate orienta selecția pacienților eligibili pentru tratament cu inhibitori ai punctelor de control imun, inclusiv pembrolizumab, aprobat pentru anumite tumori solide cu MSI-H.

Rezultatele ajută la:

• identificarea biomarkerilor predictivi și prognostici;
• selecția terapiilor aprobate de FDA și EMA, inclusiv a inhibitorilor BRAF și MEK la pacienții eligibili;
• evaluarea eligibilității pentru studii clinice și terapii inovatoare.

Analiza ctDNA poate furniza informații utile pentru monitorizarea evoluției bolii și a răspunsului la tratament, în special în stadiile avansate sau metastatice ale melanomului. Datorită caracterului minim invaziv, testul poate fi repetat periodic.

Indicații

• Pacienți diagnosticați cu melanom, pentru caracterizarea moleculară a tumorii și identificarea opțiunilor de tratament personalizat.
• Boală avansată sau metastatică, când este nevoie de biomarkeri predictivi pentru terapii țintite și imunoterapie.
• Detectarea bolii reziduale după tratamentul chirurgical oncologic.
• Tumori dificil de biopsiat sau material tumoral insuficient pentru testarea moleculară.
• Monitorizarea răspunsului la tratament și identificarea mecanismelor moleculare de rezistență.
• Progresie tumorală sau lipsă de răspuns la tratament, când este necesară reevaluarea profilului molecular.
• Identificarea pacienților eligibili pentru terapii țintite bazate pe alterări ale genelor BRAF, KIT, NRAS și ale altor gene relevante clinic.
• Stratificarea pacienților pentru alegerea celei mai potrivite strategii de tratament și evaluarea eligibilității pentru studii clinice.

Recoltare

Important: proba nu se refrigerează și nu se congelează; se păstrează la temperatura camerei, maximum 7 zile.

Dacă intervalele față de chimioterapie sau transfuzie nu pot fi respectate, în consimțământul informat se menționează data ultimei ședințe de chimioterapie și data ultimei transfuzii, după caz.

Se recomandă să se transmită următoarele informații clinice:

• diagnosticul primar și stadiul bolii;
• tratamentul actual;
• statusul actual al bolii;
• tipurile de terapii administrate anterior;
• rezultatele investigațiilor moleculare sau anatomopatologice anterioare, dacă există.

Metodă

Secvențiere de nouă generație (NGS). ADN-ul este izolat și se secvențiază toți exonii codificatori și regiunile intronice conservate ale celor 28 de gene din panel.

Testul identifică:

• variante de un singur nucleotid (SNV);
• inserții și deleții mai mici de 50 de perechi de baze (INDEL);
• variații ale numărului de copii (CNV/CNA), cu dimensiunea minimă de un exon;
• rearanjamente genice;
• instabilitatea microsateliților (MSI).

Testul este efectuat în laboratorul Medicover Genetics.

Gene analizate (28): AKT1, ALK, BRAF, CTNNB1, ERBB2, FGFR1, FGFR2, FGFR3, GNA11, GNAQ, KIT, KRAS, MAP2K1, MET, MYC, NF1, NRAS, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PDGFRA, PIK3CA, POLE, PTEN, RET, ROS1, STK11, TP53.

Interpretarea rezultatelor

Mutațiile detectate sunt evaluate și clasificate conform AMP/ASCO/CAP (Li et al., 2017; Froyen et al., 2019). Se raportează exclusiv variantele cu semnificație clinică, respectiv nivelurile I, II și III. Variantele de nivel IV (semnificație benignă sau posibil benignă) nu se raportează.

Rezultatele oferă:

• informații despre biomarkerii care pot fi folosiți în tratamentul personalizat al pacientului;
• interpretarea clinică și clasificarea rezultatelor, cu trimitere la ghiduri internaționale precum NCCN;
• terapiile la care pacientul nu răspunde sau față de care a dezvoltat rezistență;
• posibilitatea includerii pacientului într-un studiu clinic.

Se recomandă consult genetic pentru interpretarea rezultatului în context clinic.

Limite și interferențe

• Se analizează exclusiv genele incluse în panel.
• Metoda nu poate evalua variantele structurale echilibrate (translocații, inversii).
• Nu pot fi detectate inserțiile sau delețiile mai mari de 50 de perechi de baze.
• Sensibilitatea testului depinde de fracția de ADN tumoral din sânge (ctDNA). O fracție foarte scăzută poate limita detectarea unor variante.
• Un rezultat negativ nu exclude cu certitudine prezența unor variante pe care metoda nu le poate identifica.